Dự án xây dựng đường cao tốc đoạn Hòa Liên - Túy Loan, Thanh tra Bộ đề nghị Bộ GTVT (nay là Bộ Xây dựng) chỉ đạo Ban QLDA đường Hồ Chí Minh và các cơ quan, đơn vị, tổ chức có liên quan tổ chức kiểm điểm trách nhiệm do để xảy ra các vi phạm, tồn tại theo nội dung kết luận thanh tra. Thực hiện các kiến nghị đã được đoàn thanh tra chỉ ra trong kết luận thanh tra.
Xử lý về tài chính, đối với số tiền trên 3,6 tỷ đồng do lập, phê duyệt dự toán sai tăng, yêu cầu chủ đầu tư căn cứ vào nội dung hợp đồng đã ký với nhà thầu xây dựng và quy định pháp luật, để rà soát, xử lý làm cơ sở thanh, quyết toán công trình, tránh gây thất thoát vốn đầu tư xây dựng.
Giảm trừ giá trị hợp đồng với số tiền trên 4,8 tỷ đồng do trùng khối lượng với dự án xây dựng khu tái định cư Tân Ninh mở rộng giai đoạn 2.
Số tiền trên 553,6 triệu đồng do nghiệm thu trùng khối lượng, Ban QLDA đường Hồ Chí Minh có trách nhiệm thực hiện giảm trừ thanh toán trong đợt thanh toán tiếp theo.
Số tiền trên 28,6 triệu đồng do nghiệm thu, thanh toán sai (năm 2023), Ban QLDA đường Hồ Chí Minh có trách nhiệm thu hồi và nộp về tài khoản tạm giữ của Thanh tra Bộ Xây dựng.
Đối với dự án đầu tư xây dựng đường Hồ Chí Minh đoạn Rạch Sỏi - Bến Nhất, Gò Quao - Vĩnh Thuận, Thanh tra Bộ Xây dựng kiến nghị Bộ GTVT (nay là Bộ xây dựng) chỉ đạo Ban QLDA đường Hồ Chí Minh và các cơ quan, đơn vị, tổ chức chỉ đạo các cơ quan chuyên môn phối hợp với Ban QLDA đường Hồ Chí Minh kiểm tra, rà soát để bảo đảm việc lập, thẩm định, phê duyệt dự án đầu tư xây dựng có các thông số phù hợp với các quy hoạch đã được phê duyệt…
Đối với số tiền trên 8,9 tỷ đồng do công tác lập, phê duyệt dự toán sai tăng, yêu cầu chủ đầu tư căn cứ vào nội dung hợp đồng đã ký với nhà thầu xây dựng và quy định pháp luật, để rà soát, xử lý làm cơ sở thanh, quyết toán công trình. Xử lý số tiền trên 8,6 tỷ đồng do áp sai giá.
Số tiền trên 69,6 triệu đồng do nghiệm thu trùng khối lượng, Ban QLDA đường Hồ Chí Minh có trách nhiệm thực hiện giảm trừ thanh toán trong đợt thanh toán tiếp theo.