CTCP Vận tải đường sắt được thành lập trên cơ sở hợp nhất CTCP Vận tải Đường sắt Hà Nội và CTCP Vận tải Đường sắt Sài Gòn theo phương án cơ cấu lại doanh nghiệp, đơn vị trực thuộc VNR đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt tại văn bản số 303/TTg-ĐMDN ngày 07/04/2022 và quyết định 562/QĐ-TTg ngày 26/6/2024 của Thủ tướng Chính phủ phê duyệt Đề án cơ cấu lại VNR giai đoạn đến năm 2025.
Việc hợp nhất này đánh dấu bước thay đổi lớn đối với vận tải đường sắt , nhằm nâng cao hiệu quả sản xuất, kinh doanh. Đồng thời tập trung nguồn lực, tài chính, phương tiện, để tăng cường năng lực cạnh tranh, nâng cao hiệu quả quản trị doanh nghiệp, tăng khả năng huy động vốn cho các kế hoạch phát triển vận tải đường sắt.
Về cơ cấu tổ chức, Công ty sẽ gồm có 08 phòng, 17 Chi nhánh trực thuộc và cơ sở tại TP. Hồ Chí Minh, trong đó có 04 Chi nhánh Toa xe, 02 Chi nhánh Đoàn tiếp viên đường sắt và 11 Chi nhánh Vận tải đường sắt. Trụ sở CTCP Vận tải đường sắt đặt tại địa chỉ 130 đường Lê Duẩn, Hà Nội. .
Bộ máy lãnh đạo Công ty CP (CTCP) Vận tải đường sắt gồm: Hội đồng quản trị có 5 thành viên, do ông Đỗ Văn Hoan làm Chủ tịch HĐQT; Ban điều hành có 5 thành viên do ông Đào Anh Tuấn làm Tổng Giám đốc.
Các cổ đông của hai CTCP Vận tải đường sắt Hà Nội , Sài Gòn trước đây sẽ trở thành cổ đông của CTCP Vận tải đường sắt, ngoài việc được hưởng những lợi ích gia tăng từ việc hợp nhất mang lại, các cổ đông sẽ thuận lợi trong việc tìm hiểu, đánh giá chuyên sâu đối với hiệu quả hoạt động của CTCP Vận tải đường sắt và thị trường vận tải đường sắt.
Trước mắt, công ty sẽ nỗ lực thực hiện đạt và vượt các chỉ tiêu đại hội đồng cổ đông giao, hoàn thành nghĩa vụ nộp ngân sách Nhà nước ; từng bước nâng cao việc làm, đời sống cho người lao động; tập trung nâng cao năng lực cạnh tranh, phấn đấu mở rộng thị phần vận tải đường sắt cả về hành khách và hàng hoá.
Bên cạnh hoạt động kinh doanh vận tải đường sắt, công ty sẽ tập trung phát triển kinh doanh các dịch vụ hỗ trợ để gia tăng giá trị sản phẩm, tăng doanh thu tạo thêm việc làm cho người lao động.
CTCP Vận tải Đường sắt cho biết sẽ nỗ lực trong việc bảo toàn vốn và tài sản của doanh nghiệp, đảm bảo lợi nhuận và tỷ suất lợi nhuận trên vốn của doanh nghiệp theo nghị quyết đại hội đồng cổ đông công ty.