Trong ngắn hạn, Ban Quản lý tập trung tháo gỡ thủ tục cho các dự án quy mô lớn đã đăng ký, đồng thời thu hút nhà đầu tư thứ cấp vào hoạt động sản xuất – kinh doanh, qua đó góp phần thúc đẩy tăng trưởng kinh tế địa phương. Nhóm dự án được chú ý nhiều nhất thuộc Tập đoàn Hòa Phát (HoSE: HPG), gồm cảng Bãi Gốc, KCN Hòa Tâm (giai đoạn 1) và khu liên hợp gang thép Hòa Phát.
Cảng Bãi Gốc được thực hiện bởi CTCP Cảng Bãi Gốc Phú Yên, có quy mô 370ha và tổng vốn khoảng 24.000 tỷ đồng. Cảng được định hướng trở thành trung tâm logistics kết nối trực tiếp với KCN Hòa Tâm và đặc biệt phục vụ cho tổ hợp gang thép Hòa Phát.
Dự án nhà máy gang thép Hòa Phát tại Khu kinh tế Phú Yên có tổng vốn đầu tư 86.000 tỷ đồng, công suất thiết kế 6 triệu tấn thép/năm, chia hai giai đoạn (giai đoạn 1 đạt 3 triệu tấn/năm). Đây được xem là “cú đấm thép” thứ ba của Hòa Phát sau Dung Quất 1 và Dung Quất 2 tại Quảng Ngãi. Hiện dự án đã hoàn tất bước pháp lý ban đầu, được giao khoảng 500ha đất và dự kiến khởi công giai đoạn 1 trong thời gian tới.
